Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TapbpQ9R233 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms