Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim3Q9R1R2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms