Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek3Q9R0A5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms