Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms