Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp11cQ9QZW0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp11cQ9QZW0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms