Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col4a3Q9QZS0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col4a3Q9QZS0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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