Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a3Q9QZB6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a3Q9QZB6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms