Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc39a1Q9QZ03 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc39a1Q9QZ03 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms