Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Tspan3Q9QY33 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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Tspan3Q9QY33 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Tspan3Q9QY33 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tspan3Q9QY33 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tspan3Q9QY33 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tspan3Q9QY33 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Tspan3Q9QY33 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms