Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf354bQ9QXT9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms