Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS1

Plec, Plectin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 4,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlecQ9QXS1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PlecQ9QXS1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms