Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clca3a1Q9QX15 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a1Q9QX15 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms