Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad1Q9QWZ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad1Q9QWZ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms