Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Txnrd1Q9JMH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd1Q9JMH6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms