Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Prg4Q9JM99 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prg4Q9JM99 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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