Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SigirrQ9JLZ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms