Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms