Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scamp4Q9JKV5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp4Q9JKV5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms