Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ldb3Q9JKS4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms