Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms