Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ybx3Q9JKB3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms