Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnga3Q9JJZ8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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