Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms