Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog8Q9JJA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog8Q9JJA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms