Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc86Q9JJ89 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms