Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpxQ9JHS4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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