Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn12Q9ET43 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms