Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfip11Q9ERA6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfip11Q9ERA6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms