Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Swt1Q9DBQ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms