Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp2aQ9DB34 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp2aQ9DB34 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms