Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pop5Q9DB28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms