Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmem38bQ9DAV9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem38bQ9DAV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tmem38bQ9DAV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tmem38bQ9DAV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem38bQ9DAV9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms