Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnpy3Q9DAU1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms