Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Asf1bQ9DAP7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Asf1bQ9DAP7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms