Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf138rt1Q9D9M9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf138rt1Q9D9M9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Rnf138rt1Q9D9M9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf138rt1Q9D9M9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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