Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9D9H8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9D9H8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D9H8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9H8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9D9H8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms