Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldnd2Q9D9H2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms