Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnot8Q9D8X5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms