Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin37Q9D8N6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms