Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms