Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms