Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcc1Q9D4H2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms