Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UvssaQ9D479 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UvssaQ9D479 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms