Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933425L06RikQ9D3Z8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms