Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy3Q9D394 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy3Q9D394 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms