Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pramef12Q9D2F1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef12Q9D2F1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms