Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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