Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2e1Q9D0D5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms