Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms