Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nip7Q9CXK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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